1. Chỉ số COI có thể quyết định âm tính nhưng lại không quyết định dương tính. Chỉ số COI là chỉ số ngưỡng phản ứng. Khi chỉ số HIV Combi PT < 1.0 COI được xem là không có phản ứng trong xét nghiệm và được khẳng định âm tính đối với HIV. Mẫu xét nghiệm có chỉ số ngưỡng > 1.0 COI, nghĩa là có phản ứng trong xét nghiệm HIV combi PT và cần phải làm xét nghiệm khẳng định bằng các phương pháp khác là Western Blot và HIV RNA. Tất cả các mẫu có chỉ số ngưỡng < 1.0 COI là âm tính nên khi âm tính có thể có các giá trị ngưỡng khác nhau nhưng đều < 1.0 COI.

2. Mỗi lần xét nghiệm chỉ số COI lại thay đổi nhưng đều < 1.0 COI đều được khẳng định âm tính. Các lần xét nghiệm này không có phản ứng mà chỉ là tín hiệu ngưỡng của các lần đo khác nhau của phương pháp phân tích.

3. Phương pháp HIV Conbi PT không khẳng định dương tính mà phải kết hợp với các phương pháp khác là Western Blot và HIV RNA mới được khẳng định dương tính.

4. Phương pháp HIV Combi PT có thể phát hiện sau khi có yếu tố lây nhiễm từ 6-12 tuần sớm hơn 6 ngày so với các phương pháp cũ.